阜南县疾病预防控制中心是2006年卫生体制改革在原县卫生防疫站的基础上成立的全额副科事业单位，座落于阜南县富坡大道与谷河路交叉口，是全县疾病预防与控制、应急预警与处置、疫情收集与报告、儿童免疫规划实施与管理、监测检验与评价、健康教育与促进、技术管理与服务的公共卫生机构，也是全县疾病预防控制技术服务、培训和指导中心，是全县职业健康体检的法定单位。

中心机构健全，人员齐备。中心占地面积12654平方米，内设免疫规划、艾滋病防治、结核病防治、地方病防治、公共卫生、急性传染病防治、监测、学卫、综合门诊等16个科室。现有在职职工100人，其中专业技术人员79人，中高级职称22人。

中心拥有气象色谱仪、全自动生化分析仪、全自动荧光定量PCR检测系统、酶标仪、洗板机、超净工作台、荧光显微镜、-30℃低温冰柜、200MAX光机、流式细胞检测仪。
  抚今追昔，感慨万千。疾控人始终坚持为人民健康服务的宗旨，坚持预防为主的方针，以疾病预防控制为中心，不断加强卫生监测检验、免疫规划、地方病防治及疫情信息管理网络建设，全方位、多层次地开展疾病预防工作，取得了显著成绩。

为充分发挥疾控中心疾病防控职能，更好地为阜南县人民群众健康服务，疾控中心正积极筹建慢性病防治中心，规划设置健康教育中心、慢性病筛查中心、慢性病诊疗中心、检验中心（包括艾滋病初筛实验室、微生物实验室、饮用水检测实验室和临床检验实验室）和精神卫生中心5个分中心，以及阜南县疾病预防控制中心的公共卫生服务职能科室与行政办公区。项目规划新建业务用房总面积28000平方米，设置床位150张，规划建设主楼17层（其中地下一层），副楼3层。项目预算总投资8000万元。

展望未来，任重道远。阜南县疾控人本着“诚信为民，务实创新，开拓进取，敢为人先”的精神，全面落实预防为主的方针，为全县人民健康服务，为全县经济建设和社会发展服务。